Léčba atopického ekzému vychází ze znalosti jeho příčin a správného ošetřování kůže. U pacienta mají být sledovány vlivy prostředí - zevní škodliviny, lokální prostředky dostávající se do kontaktů s kůží, možný vliv stravy a inhalačních alergenů, psychický stres a další.

Atopický ekzém se často sdružuje s alergiemi, ale jde spíše o doprovodný jev než jeho příčinu. Způsobů léčby je mnoho, ale žádný nevede k trvalému vyléčení.