Léčba alergií a astmatu v těhotenství je vedena na základě mezinárodních doporučení, vypracovávaných americkou institucí FDA. V těhotenství volíme léky podle kategorií bezpečnosti, kde jsou zařazeny i antihistaminika, bronchodilatancia a inhalační kortikosteroidy.
30 % těhotných má projevy rýmy, nejčastěji hormonálního původu. Podávání volně dostupných nosních kapek typu Sanorin, Nasivin, Olynth lze jen krátkodobě, tj. nejdéle po dobu 7 dnů. Přijatelnější je podávání nosních sprejů s lokálními kortikosteroidy.
Pálení žáhy nebo v krku během těhotenství způsobuje často návrat žaludečního obsahu do jícnu, nazývaný gastroezofageální reflux. Léčí se úpravou polohy těla při spánku, změnou stravy a případně, od 4. měsíce těhotenství, léky typu omeprazol.